Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNASE1L3Q13609 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms