Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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C1orf61Q13536 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C1orf61Q13536 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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