Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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