Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHAF1BQ13112 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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