Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN3Q13064 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
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