Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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