Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STX4Q12846 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STX4Q12846 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STX4Q12846 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STX4Q12846 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STX4Q12846 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STX4Q12846 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STX4Q12846 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STX4Q12846 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STX4Q12846 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STX4Q12846 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STX4Q12846 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STX4Q12846 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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