Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNL1Q0VF96 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms