Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GOLGA3Q08378 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA3Q08378 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms