Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF4Q08170 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF4Q08170 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms