Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCN1BQ07699 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms