Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFF3Q07654 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms