Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms