Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms