Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP1Q04837 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP1Q04837 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms