Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7AQ04656 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7AQ04656 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms