Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CREMQ03060 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CREMQ03060 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREMQ03060 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREMQ03060 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREMQ03060 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CREMQ03060 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CREMQ03060 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms