Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APBA1Q02410 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms