Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms