Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms