Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKL1Q00532 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms