Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms