Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2C1P98194 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2C1P98194 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms