Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGD1P98174 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGD1P98174 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGD1P98174 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms