Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms