Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms