Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP107P57740 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms