Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms