Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LUMP51884 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LUMP51884 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LUMP51884 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms