Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB28P51157 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB28P51157 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB28P51157 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms