Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP4P49662 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP4P49662 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP4P49662 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP4P49662 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms