Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTPAP49638 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTPAP49638 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TTPAP49638 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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