Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMPOP42166 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMPOP42166 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMPOP42166 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMPOP42166 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms