Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms