Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LTBRP36941 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBRP36941 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBRP36941 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms