Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6V1E1P36543 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms