Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP5C1P36542 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms