Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN2P35609 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms