Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms