Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKARP32238 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKARP32238 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKARP32238 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKARP32238 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms