Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC12P31275 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms