Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A5P29400 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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