Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLD1P28340 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLD1P28340 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLD1P28340 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD1P28340 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD1P28340 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD1P28340 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD1P28340 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD1P28340 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD1P28340 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD1P28340 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD1P28340 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLD1P28340 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms