Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNMT1P26358 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT1P26358 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms