Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms