Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERBB3P21860 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERBB3P21860 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms