Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XBP1P17861 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
XBP1P17861 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
XBP1P17861 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms