Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GLI3P10071 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI3P10071 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI3P10071 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI3P10071 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GLI3P10071 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GLI3P10071 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GLI3P10071 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GLI3P10071 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GLI3P10071 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI3P10071 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms