Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGB3P0DN86 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms