Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms